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Elementi di chimica biologica - Torino A

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ELEMENTS OF BIOLOGICAL CHEMISTRY

Oggetto:

Anno accademico 2017/2018

Codice dell'attività didattica
SUI0159_TOA
Docenti
Dott. Roberto Mazzoli (Titolare del corso)
Prof. Carlo Lamberti (Titolare del corso)
Dott. Elisa Borfecchia (Titolare del corso)
Corso di studi
[f091-c701] SCIENZE DELLE ATTIVITÀ MOTORIE E SPORTIVE
Anno
2° anno
Periodo didattico
Primo semestre
Tipologia
Di base
Crediti/Valenza
8
SSD dell'attività didattica
BIO/10 - biochimica
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Obbligatoria
Tipologia d'esame
Scritto
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

Modulo Biochimica

Il corso si propone di fornire le conoscenze di base sulla chimica degli organismi viventi. Tali conoscenze comprendono la struttura e l'organizzazione della materia vivente (struttura e funzione delle principali macromolecole biologiche) ed i meccanismi biochimici alla base del mantenimento dell'omeostasi negli organismi viventi (metabolismo, respirazione).

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Modulo di Chimica

• Conoscenza degli strumenti matematici e fisici di base necessari per la comprensione di  contenuti scientifici più specifici in ambito chimico e biochimico.

• Conscenza di base della struttura e delle proprietà della materia, in termini di struttura atomica e legame chimico.

• Conoscenza delle basi della chimica generale e organica

Biochemistry module

The present course aims at providing essential information on biochemistry of living organisms. This information includes structure and organization of living organisms (structure and fuction of the main biological macromolecules) and biochemical mechanisms used by living organisms for maintenance of homeostasis (metabolism, respiration)

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Chemistry Module

•Basic knowledge of the mathematical and physical instruments and formalism needed to properly deal with Chemistry and Biochemistry problems

• Basic knowledge of the structure and properties of matter, focusing on atomic structure and chemical bounding.

• Basic knowledge of General and Organic Chemistry

 

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Risultati dell'apprendimento attesi

Modulo Biochimica Conoscenza delle basi molecolari della struttura e delle funzioni degli organismi viventi.

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Modulo di Chimica

•Saper lavorare con potenze e logaritmi e saper risolvere semplici equazioni 1° e 2° grado. • Saper leggere e interpretare un grafico e conoscere le principali funzioni. • Conoscere i livelli su cui si organizza la materia  e le sue principali proprietà. • Conoscere e utilizzare il concetto di mole, massa atomica, massa molecolare. • Conoscere le principali grandezze fisiche, le loro unità di misura e caratteristiche  e padroneggiare la notazione scientifica. • Conoscere le forze fondamentali e il loro ambito di azione. • Conoscere a livello semplice la struttura dell'atomo quantistico e la natura dei principali tipi di legame chimico. • Conoscere alcune reazioni chimiche elementari. • Conoscere il concetto di pH e di equilibrio chimico. • Conoscere i principali composti organici e gruppi funzionali di interesse in ambito biochimico

Biochemistry module Essential knowledge of molecular basis of structure and functions of living organisms.

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Chemistry Module

• Being able to work with powers and logarithms, to solve simple equations (1st and 2nd degree). • Being able to correctly interpret the graph of a function and to recognize the principal categories of functions. • Knowing the levels on which matter is organized. • Knowing and correctly using the concepts of mole, atomic mass, molecular mass. • Knowing the principal physical quantities and their units. • Correctly use the exponential notation. • Knowing which are the fundamental forces and their range. •Knowing the basis of the quantum atomic structure and the principal kinds of chemical bounds. •Knowing the concept of chemical reaction and few elementary classes of reactions. Knowing and correctly using the concepts of pH and chemical equilibrium. • Knowing the principal organic compounds and functional groups of interest in the field of Biochemistry.

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Modalità di insegnamento

Modulo Biochimica:  Il corso si  compone di  40 ore di lezioni teoriche. Le slide presentate a lezione sono fornite agli studenti nel materiali didattico online. 

Modulo di Chimica: Il corso si compone di 24 ore di lezioni teoriche e esercitazioni in aula. Le slide presentate a lezione e una raccolta di questi tipo esame sono forniti agli studenti nel materiali didattico online.

Biochemistry module The course consists of 40 hours of lectures. The slides presented during lectures are available to students as online material.

Chemistry Module: the course is composed by 24 h of theoretical lessons and exercises. In the section devoted to teaching materials, the slides presented during the lessons and a collection of exercises (similar to the ones which will be proposed at the exam) are available.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

Regole generali

Per iscriversi all'esame occorre prenotarsi sul sito UNITO: la prenotazione è OBBLIGATORIA

Occorre presentarsi all'esame con il libretto universitario o con un documento di identità valido.

Non si può sostenere l'esame più di 3 volte durante l'anno accademico.

 Calcolo del punteggio dei test e relativi voti per i singoli moduli

Modulo Chimica:

Test scritto :  17 domande a risposta multipla (30 minuti): risposta corretta 2 punti, risposta sbagliata: -0.5 punti, risposta non data 0 punti. Massimo totalizzabile = 34 punti. Punteggio uguale a 30 o 31 punti voto = 30/30. Punteggio uguale o maggiore di 32 punti voto = 30 L.

Modulo Biochimica:

Test scritto :  26 domande a risposta multipla (30 minuti): risposta corretta 1 o 2 punti (a seconda della domanda) , risposta sbagliata o non data 0 punti. Massimo totalizzabile = 33 punti. Punteggio uguale a 30 punti voto = 30/30. Punteggio uguale o maggiore di 31 punti voto = 30 L.

Calcolo del voto complessivo

I test sufficienti (voti compresi tra 18/30 e 30/30 L)  dei singoli moduli saranno utilizzati per calcolare il VOTO COMPLESSIVO DELL'ESAME (modulo biochimica + modulo chimica) attraverso la MEDIA PESATA (valore modulo chimica 3/8, valore modulo biochimica 5/8).

Saranno considerati «validi» anche voti pari o superiori a 15 per il singolo modulo (chimica o biochimica) a patto che la media complessiva sia ≥ 18

PER IL SUPERAMENTO DELL'ESAME SARÀ NECESSARIO SUPERARE ENTRAMBI I MODULI NEL CORSO DELLO STESSO APPELLO. I VOTI PARZIALI NON SARANNO CONSERVATI DA UN APPELLO ALL'ALTRO.

General Rules

To register to the written test students should use the UNITO platform: online registration is MANDATORY

To attend to the written test, valid university card or identity card is mandatory.

A maximum of 3 attempts per academic year is allowed.

Calculation of the test score and corresponding note for each module

Chemistry module:

Written multiple choice test composed by 17 questions (30 minutes): correct answer: 2 pts; wrong answer -0.5 pts; blank answer: 0 pts. Maximum score: 34 pts. With a score of =>32 the note will be = 30L.

Biochemistry module:

Written multiple choice test composed by 26 questions (30 minutes): each correct answer = 1/30 or 2/30 depending on the answer, incorrect answer or not-given answer = 0 points. Maximum points achievable = 33. With a number of points  >30  the note will be = 30L.

Calculation of the final note

Valid tests (notes comprised between 18/30 and 30/30 L)  for the single modules will be used to calculate to final note of the exam (chemistry plus biochemistry) by using the weighted mean (chemistry module value 3/8; biochemistry module value 5/8).

Also single module (chemistry or biochemistry) tests with a note higher than 15 will be considered valid, but only if the global weighted mean is ≥ 18

FOR SUCCESSFULLY PASSING THE EXAM IT WILL BE NECESSARY TO PASS BOTH MODULES IN THE SAME EXAM DATE. PARTIAL NOTES WILL NOT BE CONSERVED IN THE FOLLOWING EXAMS.

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Programma

Modulo Biochimica

PROPEDEUTICA BIOCHIMICA

BIOCHIMICA STRUTTURALE E DESCRITTIVA.

Che cos'è la biochimica, studio delle molecole biologiche. Principi generali della nutrizione.

CARBOIDRATI. Monosaccaridi, oligosaccaridi, polisaccaridi

LIPIDI. Triacilgliceroli, acidi grassi; colesterolo e derivati; lipidi di membrana e cenni sulla struttura e la funzione delle membrane biologiche.

ACIDI NUCLEICI, BASI MOLECOLARI DELL'EREDITARIETA' ED ESPRESSIONE GENICA. Nucleotidi. Struttura del DNA e del RNA. Cenni sui meccanismi di replicazione, trascrizione e traduzione.

AMMINOACIDI, PEPTIDI E PROTEINE. Funzione delle proteine. Amminoacidi. Legame peptidico e peptidi. Struttura delle proteine. Classificazione e proprietà delle proteine. Collagene.

INTRODUZIONE AL METABOLISMO

ENZIMI. Ruolo degli enzimi nel metabolismo. Principali caratteristiche biochimiche degli enzimi. Meccanismi di regolazione dell'attività enzimatica.

VITAMINE.  Ruoli e funzioni biologiche delle vitamine liposolubili e idrosolubili

BIOENERGETICA E CATABOLISMO. Metabolismo energetico, sintesi di ATP. Glicolisi, acidosi lattica. Ciclo degli acidi tricarbossilici. Trasporto elettronico e fosforilazione ossidativa. Catabolismo dei lipidi e degli amminoacidi. Ureogenesi. Cenni alla digestione delle macromolecole biologiche.

ARGOMENTI SPECIALISTICI

EMOPROTEINE. Emoglobina, mioglobina, citocromi. Il trasporto dell'ossigeno e della CO2.

SISTEMA CONTRATTILE. Le proteine contrattili actina e miosina, il meccanismo della contrazione muscolare. Fonti energetiche per la contrazione muscolare.

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Modulo di Chimica

Presentazione del modulo e modalità d'esame

Richiami di matematica:

  • Potenze e proprietà delle potenze
  • Radici e alcune proprietà delle radici
  • Definizione di logaritmo, logaritmi decimali e naturali
  • Richiami di calcolo letterale: utilità del calcolo letterale, operazioni con monomi e polinomi
  • Equazioni: utilità del concetto di equazione, grado e numero di soluzioni di un'equazione
  • Equazioni di 1° grado e principi di equivalenza
  • Equazioni di 2° grado, formula risolutiva e casi del determinante
  • Introduzione al concetto di funzione y=f(x)
  • Generalità sul piano cartesiano
  • Rappresentazione grafica di una funzione sul piano cartesiano
  • Classificazione delle funzioni
  • La retta: equazione della retta y=mx+q e sua rappresentazione cartesiana, significato di coefficiente angolare e termine noto
  • La parabola: equazione della parabola y=ax2+bx+c e sua rappresentazione sul piano cartesiano, significato dei parametri a, b, c
  • Cenni sulle funzioni esponenziale e logaritmica

Richiami di fisica

  • Richiami introduttivi: concetti di fenomeno, grandezza fisica, strumento di misura e legge fisica
  • Grandezze fisiche fondamentali e derivate e Sistema Internazionale delle unità di misura
  • Grandezze fisiche scalari e vettoriali: definizioni e esempi
  • Notazione scientifica esponenziale, concetto di ordine di grandezza e relativi prefissi del Sistema Internazionale
  • Breve carrellata sulle scale di lunghezza tipiche del nostro universo
  • I e II legge della dinamica,
  • forze di contatto e forze a distanza,
  • interazione fondamentali (gravitazionale, elettromagnetica, nucleare forte e debole), loro caratteristiche e rilevanza alla scala atomica-molecolare

Richiami di struttura e proprietà della materia

  • L'atomo: modello "planetario", numero atomico e numero di massa atomica
  • Isotopi, abbondanza isotopica, stabilità dei nuclidi e radioattività
  • Unità di massa atomica, massa atomica e molecolare
  • Richiami sulla tavola periodica degli elementi
  • Concetto di mole, numero di Avogadro, massa molare
  • Conversioni tra numero di moli e massa di sostanza

Soluzioni, reazioni ed equilibrio chimico

  • Le soluzioni. Definizioni di soluto e solvente. La concentrazione. La concentrazione molare: la Molarità. La solubilità. Le regole di solubilità. Equilibrio chimico. Equilibri in soluzione. Soluzioni acquose ed elettroliti. L'equilibrio di dissociazione dell'acqua. Elettroliti forti e deboli. Costante di equilibrio. Legge di azione di massa.
  • Coefficienti stechiometrici. Alcune reazioni chimiche: Reazioni di precipitazione. Reazioni di scambio e doppio scambio. Reazioni di sintesi e di dissociazione. Bilanciamento delle reazioni chimiche. Esercizi.
  • Definizione di acido e di base (acidi/basi di Brönsted). Reazioni acido-base. Acidi e basi forti, acidi e basi deboli. Acidi poliprotici. pH. Calcolo del pH in varie soluzioni. Dissoluzione di sali e relativo pH. Curve di titolazione acido-base (acido forte più base forte, acido debole più base forte, acido forte più base debole, acido debole più base debole). Gli indicatori. Reazioni di idrolisi. Sostanze anfotere. Soluzioni tampone.
  • Numero di ossidazione. Reazioni di ossido-riduzione. Bilanciamento delle reazioni REDOX. Esempi.

Atomo quantistico e legame chimico

  • Modello atomico a shell e concetto di quantizzazione
  • Orbitali atomici e interpretazione probabilistica, numeri quantici, configurazione elettronica, livello di valenza
  • Concetto di legame chimico e energia di legame
  • Regola dell'ottetto
  • Legame ionico e covalente, definizione di elettronegatività
  • Legame covalente puro e polare
  • Strutture di Lewis: procedura, esempi e esercitazioni
  • Cenni alle eccezioni alla regola dell'ottetto ed alla risonanza
  • Geometria molecolare e teoria VSEPR
  • Cenni alla teoria del legame di valenza: legame come sovrapposizione di orbitali, legami covalenti di tipo sigma e pi-greco, ibridazione, orbitali ibridi sp, sp2, sp3
  • Legami intermolecolari: legame a idrogeno

Cenni di Chimica Organica

  • Definizione di chimica organica.
  • Alcuni dei principali elementi chimici delle molecole organiche: H, C, N, O, S, alogeni.
  • Formula bruta e formula di struttura in chimica organica. Formule di Lewis.
  • Orbitali ibridi e ibridazione del carbonio (sp3, sp2, sp).
  • I Gruppi funzionali e alcuni dei principali composti organici: idrocarburi alifatici (alcani, alcheni, alchini) aliciclici (cicloalcani, cicloalcheni, ciclodieni, cicloalchini), idrocarburi aromatici e composti polinucleari ed eterociclici, alcoli, aldeidi e chetoni, acidi carbossilici, esteri, eteri, ammine, ammidi. Cenni di nomenclatura.
  • Alcuni esempi di legame ammidico: il nylon e il Legame peptidico. Gli amminoacidi. L'isomeria. Isomeria di catena, stereoisomeria, isomeria conformazionale e configurazionale, isomeri geometrici e stereoisomeri.

Ripasso ed esercitazioni

  • Parte 1: Risoluzione in aula di quesiti tipo esame (matematica, fisica, struttura della materia, legame chimico)
  • Parte 2: Risoluzione in aula di quesiti tipo esame (reazioni e soluzioni, chimica organica)

 

Biochemistry module

INTRODUCTORY BIOCHEMISTRY

STRUCTURAL BIOCHEMISTRY.

What is the biochemistry, the study of biological molecules. General principles of nutrition.

Carbohydrates. Monosaccharides, oligosaccharides, polysaccharides

LIPID. Triacylglycerols, fatty acids; cholesterol and derivatives; membrane lipids and notes on the structure and function of biological membranes.

NUCLEIC ACIDS, MOLECULAR BASIS OF GENE HEREDITY AND GENE EXPRESSION. Nucleotides. Structure of DNA and RNA. Outline of the mechanisms of replication, transcription and translation.

Amino acids, peptides and proteins. Protein function. Amino acids. Peptides and peptide bond. Protein structure. Classification and properties of proteins. Collagen.

INTRODUCTION TO METABOLISM

ENZYMES. Role of enzymes in metabolism. Main biochemical characteristics of enzymes. Mechanisms of regulation of enzyme activity.

VITAMINS. Roles and biological functions of fat soluble and water-soluble vitamins.

BIOENERGETICS and catabolism. Energy metabolism, synthesis of ATP. Glycolysis, lactic acidosis. Citric acid cycle. Electron transport and oxidative phosphorylation. Catabolism of lipids and amino acids. Ureogenesis. Digestion of biological macromolecules.

SPECIAL TOPICS

Heme proteins. Hemoglobin, myoglobin, cytochromes. The transport of oxygen and CO2.

MUSCLE CONTRACTION. Contractile proteins actin and myosin, the mechanism of muscle contraction. Sources of energy for muscle contraction. 

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Chemistry Module

General presentation of the Module and of the Exam Modalities

Elements of Mathematics

  • Powers and their properties
  • Roots and their key properties
  • Logarithms and their properties
  • Equations: general concept and utility, degree and number of solutions
  • First-degree equations and Second-degree equations
  • Introduction to the function concept y=f(x)
  • Introduction to the Cartesian plane and to the Cartesian representation of a function
  • Principal classes of functions
  • The line equation y=mx+q: Cartesian representation and meaning of the m and q parameters
  • The parabola equation y=ax2+bx+c: Cartesian representation and meaning of the a, b and c parameters
  • Generalities on exponential and logarithmic functions.

Elements of Physics

  • General introduction to the concepts of physical quantity, measure and physical law
  • Fundamental and Derived physical quantities and International System of Units
  • Scalars and Vectors
  • Exponential notation, order of magnitude and prefixes of the International System of Units
  • Overview on the typical length scales in our universe
  • I and II Newton's laws
  • Contact forces and force fields
  • Fundamental forces: Gravity, Electromagnetic force, Nuclear interactions: key characteristics and relevance in Chemistry

Structure and properties of matter

  • The "planetary" atomic model, atomic number Z, atomic mass number A
  • Isotopes and isotopic abundance
  • Definition of Atomic Mass Units; atomic and molecular mass
  • The Periodic Table of the Elements
  • Concept of mole, Avogadro's number, molar mass
  • Conversion between number of moles and mass

Solutions, Reactions, and Chemical Equilibria

  • Solutions. Definition of solute and solvent. Concentration. Molar concentration: Molarity. Solubility. Chemical equilibrium and chemical equilibrium in solution. Aqueous solution and elettrolites. Water dissociation equilibrium. Strong and weak elettrolites. Equilibrium constant. Mass Action Law.
  • Stoichiometric coefficients. Some basic examples chemical reactions. Balancing a chemical reaction, with exercises.
  • Definition of acids and bases. Acid-base reactions. Strong and weak acids. Polyprotic acids. Definition of pH and determination of the pH of a solution. Acid-base titration curves. pH indicators. Hydrolysis reactions. Anphoteric compounds. Buffer solutions.
  • Oxidation number. RED-OX reactions and their balance, with examples.

Quantum atom and chemical bonding

  • Shell atomic model and energy quantisation
  • Atomic orbitals and their probabilistic interpretation, quantum numbers, electronic configurations, valence level.
  • Chemical bonding and bonding energy
  • The Octet Rule
  • Ionic and covalent bonds, definition of electronegativity
  • Pure and polar covalent bond
  • Lewis's structures, with exercises
  • Molecular geometry and VSEPR theory
  • Valence Bond theory: bonding described as superimposition of orbitals, sigma and pi covalent bonds, hybrid orbitals sp, sp2, sp3
  • Inter-molecular bonds: H-bonding

Elements of Organic Chemistry

  • Definition of Organic Chemistry
  • Empirical Structure formula in Organic Chemistry.
  • Carbon sp3, sp2, sp hybridisation.
  • Functional groups and principal classes of organic compounds, with basics of nomenclature: aliphatic hydrocarbons (alkanes, alkenes, alkynes), alicyclics (cycloalkanes, cycloalkenes, cyclodienes, cycloalkynes), aromatic hydrocarbons, heterocyclic compounds, alcohols, aldehydes, ketones, carboxylic acids, esters, ethers, ammines, amides.
  • Some examples of amidic bonding: nylon and peptide bonding. Amino acids. Isomerism: chain isomerism, stereo-isomerism, conformational and configurational isomerism, geometrical isomers and stereoisomers.

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:


Modulo di Biochimica

Slides del corso

A. Di Giulio, A. Fiorilli, C. Stefanelli. Biochimica per le scienze motorie, 2011, Casa Editrice Ambrosiana.

D.L. Nelson, M. M. Cox. Introduzione alla biochimica di Lehninger, 4° Edizione, 2011, Zanichelli Editore.

F.A. Betteheim, W.H. Brown, M.K. Campbell, S.O. Farrell. Chimica e Propedeutica Biochimica, Edises

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Modulo di Chimica:

-Slide presentate a lezione (sufficienti per preparare adeguatamente l'esame)

- Qualsiasi testo di livello scuola superiore di Matematica, Fisica o Chimica a seconda degli argomenti trattati.

Testo di riferimento per rivedere ed approfondire la parte di chimica: M. Stefani e N. Taddei. Chimica, biochimica e biologia applicata. Terza edizione. Zanichelli.  (Capitoli 1-10).


Biochemistry module

Slides of the lectures

A. Di Giulio, A. Fiorilli, C. Stefanelli. Biochimica per le scienze motorie, 2011, Casa Editrice Ambrosiana.

D.L. Nelson, M. M. Cox. Introduzione alla biochimica di Lehninger, 4° Edizione, 2011, Zanichelli Editore.

F.A. Betteheim, W.H. Brown, M.K. Campbell, S.O. Farrell. Chimica e Propedeutica Biochimica, Edises

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Chemistry Module

- Slides presented during the lessons (enough to satisfactory pass the exam)

- Any textbook of Mathematics, Physics or Chemistry at the High School level.

- Reference textbook for the Chemistry part: M. Stefani e N. Taddei. Chimica, biochimica e biologia applicata. Terza edizione. Zanichelli.  (Capitoli 1-10).



Oggetto:

Orario lezioni

GiorniOreAula
Lunedì13:00 - 15:00
Martedì8:30 - 11:30

Lezioni: dal 16/10/2017 al 02/02/2018

Nota: La lezione del Lunedì si svolgerà presso la SAA, via Ventimiglia 115, Torino.
La lezione del Martedì si svolgerà presso il Palavela, via Ventimiglia 145, Torino.

Oggetto:
Ultimo aggiornamento: 14/01/2018 15:41
Location: https://scienzemotorie.campusnet.unito.it/robots.html
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